Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf1-201ENSMUST00000075693 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Uhrf1bp1B2KF50 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms