Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Prr16A3KMN5 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Prr16A3KMN5 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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