Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Samt1A2BED8 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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