Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Syndig1A2ANU3 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms