Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fam43bA2AM80 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fam43bA2AM80 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms