Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ambra1A2AH22 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ambra1A2AH22 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms