Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Pramef6A2A8M8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms