Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
PtprfA2A8L5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PtprfA2A8L5 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms