Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm3550W4VSN7 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms