Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Homer1Q9Z2Y3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Homer1Q9Z2Y3 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms