Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

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Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Hdac5Q9Z2V6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Mrpl2-202ENSMUST00000113429 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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Hdac5Q9Z2V6 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Hdac5Q9Z2V6 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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