Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Mrpl40Q9Z2Q5 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Mrpl40Q9Z2Q5 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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