Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ubl3Q9Z2M6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ubl3Q9Z2M6 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms