Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Crlf3Q9Z2L7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Crlf3Q9Z2L7 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms