Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Mbd3Q9Z2D8 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Mbd3Q9Z2D8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms