Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lgr5Q9Z1P4 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lgr5Q9Z1P4 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms