Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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TapbpQ9R233 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
TapbpQ9R233 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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