Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Wdr54Q9R0D8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms