Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Nubp2Q9R061 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Nubp2Q9R061 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms