Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

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Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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AmfrQ9R049 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
AmfrQ9R049 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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