Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR9

Col4a4, Collagen alpha-4(IV) chain, mousemouse

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Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a4Q9QZR9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Col4a4Q9QZR9 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Col4a4Q9QZR9 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Col4a4Q9QZR9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
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Col4a4Q9QZR9 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Col4a4Q9QZR9 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
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