Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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Trpc3Q9QZC1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Trpc3Q9QZC1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Trpc3Q9QZC1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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