Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Tnnt3Q9QZ47 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Tnnt3Q9QZ47 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Tnnt3Q9QZ47 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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Tnnt3Q9QZ47 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
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Tnnt3Q9QZ47 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Tnnt3Q9QZ47 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
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Tnnt3Q9QZ47 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Tnnt3Q9QZ47 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
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