Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF9

Ndrg3, Protein NDRG3, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndrg3Q9QYF9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ndrg3Q9QYF9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ndrg3Q9QYF9 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms