Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY53

Nphp1, Nephrocystin-1, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp1Q9QY53 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm26878-201ENSMUST00000181778 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nphp1Q9QY53 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms