Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Fen1-201ENSMUST00000025651 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim44Q9QXA7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Trim44Q9QXA7 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms