Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Trem1Q9JKE2 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms