Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Scamp5Q9JKD3 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms