Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Mir6923-201ENSMUST00000184592 72 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm42779-201ENSMUST00000198807 406 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Gm44552-201ENSMUST00000205458 1247 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Ecsit-204ENSMUST00000180180 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ybx3Q9JKB3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ybx3Q9JKB3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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