Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

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Length 490 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lmbr1Q9JIT0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lmbr1Q9JIT0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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Lmbr1Q9JIT0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Lmbr1Q9JIT0 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Lmbr1Q9JIT0 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Lmbr1Q9JIT0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lmbr1Q9JIT0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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