Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Syde1Q9DBZ9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms