Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
SrpraQ9DBG7 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
SrpraQ9DBG7 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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