Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ercc5-201ENSMUST00000027214 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usp12Q9D9M2 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms