Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx5Q9D8U8 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms