Protein–RNA interactions for Protein: Q9D658

Ptp4a3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptp4a3Q9D658 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ptp4a3Q9D658 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ptp4a3Q9D658 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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