Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

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Length 307 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Gm3404Q9D506 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm3404Q9D506 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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