Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
H2al3Q9D4U4 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms