Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Lonrf3Q9D4H7 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.4 ms