Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

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Length 158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trappc6bQ9D289 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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