Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C1

Ube2c, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 C, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2cQ9D1C1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Xpnpep1-209ENSMUST00000183108 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Ube2cQ9D1C1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Ube2cQ9D1C1 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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