Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ28

Snf8, Vacuolar-sorting protein SNF8, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snf8Q9CZ28 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Snf8Q9CZ28 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Snf8Q9CZ28 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.5 ms