Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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RpainQ9CWY9 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RpainQ9CWY9 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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