Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Prkrip1Q9CWV6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms