Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Atg12Q9CQY1 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Atg12Q9CQY1 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms