Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 St6galnac6-202ENSMUST00000081879 2345 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Smim8Q9CQQ0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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