Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccer1Q9CQL2 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
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