Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rab5aQ9CQD1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Rab5aQ9CQD1 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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