Protein–RNA interactions for Protein: Q99N09

Ms4a6b, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 6B, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a6bQ99N09 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ms4a6bQ99N09 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms