Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rcbtb2Q99LJ7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms