Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Sh3bp5lQ99LH9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp5lQ99LH9 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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